Différences
Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
| Les deux révisions précédentes Révision précédente Prochaine révision | Révision précédente Prochaine révisionLes deux révisions suivantes | ||
| hypre [2008/01/07 13:48] – gerard | hypre [2009/10/20 12:54] – gerard | ||
|---|---|---|---|
| Ligne 1: | Ligne 1: | ||
| - | |||
| ====== Site ====== | ====== Site ====== | ||
| - | [[http://www.llnl.gov/CASC/linear_solversm|Lien externe]] | + | [[https://computation.llnl.gov/casc/hypre/|Lien externe]] |
| ====== Version 1.6.0 ====== | ====== Version 1.6.0 ====== | ||
| Ligne 8: | Ligne 7: | ||
| * / | * / | ||
| * les exemples et la doc sont accessibles: | * les exemples et la doc sont accessibles: | ||
| + | |||
| + | |||
| + | |||
| ====== Version 2.0.0 ====== | ====== Version 2.0.0 ====== | ||
| * installé sur nemo | * installé sur nemo | ||
| - | | + | |
| - | * le configure se fait à partir du script [[http:// | + | ^ chemin ^ précision ^ script pour recompiler ^ features ^ compilateurs ^ MPI ^ |
| + | | / | ||
| + | | / | ||
| + | | / | ||
| + | | / | ||
| + | | / | ||
| + | | / | ||
| + | | / | ||
| + | | / | ||
| + | | | | / | ||
| + | |||
| + | |||
| + | ===== Exemples ===== | ||
| + | | ||
| + | < | ||
| + | [[http:// | ||
| * penser à utiliser le compilateur Studio 12, avec la commande | * penser à utiliser le compilateur Studio 12, avec la commande | ||
| - | < | ||
| - | > module load ss12 | ||
| + | < | ||
| + | module load ss12 | ||
| </ | </ | ||
| Le **path** idéal devrait au moins contenir: | Le **path** idéal devrait au moins contenir: | ||
| < | < | ||
| PATH=/ | PATH=/ | ||
| - | |||
| </ | </ | ||
| + | * [[hypre_patches|patches]] | ||
| + | |||
| + | |||
| + | ==== ex1 ==== | ||
| - | * testé l' | + | * testé l' |
| < | < | ||
| nemo-henry% mprun -np 2 ex1 | nemo-henry% mprun -np 2 ex1 | ||
| Ligne 48: | Ligne 68: | ||
| </ | </ | ||
| - | * modifié le Makefile du répertoire exemples pour que ça marche: | + | ==== ex5 ==== |
| + | avec SS12u1 et HPC6.0 | ||
| < | < | ||
| - | nemo-henry% diff Makefile-dist Makefile | + | mpcc -g -m64 -I$HYPRE/ |
| - | 4,6c4,6 | + | mpcc -m64 -fast -fsimple=0 -fns=no -xnolibmopt -o ex5 ex5.o -g -L$HYPRE/ |
| + | mprun -np 4 ex5 | ||
| + | </ | ||
| + | |||
| + | ==== ex5b77 ==== | ||
| + | en 64 bits: | ||
| + | < | ||
| + | nemo-henry% module purge; module load hypre2.0.0_hpc6 | ||
| + | nemo-henry% mpf77 -g -m64 -dalign -I$HYPRE/ | ||
| + | nemo-henry% mpf77 -v -m64 -fast -fsimple=0 -fns=no -xnolibmopt -xalias=actual -dalign -o ex5b77 ex5b77.o -L$HYPRE/ | ||
| + | </ | ||
| + | |||
| + | ====== Modifications ====== | ||
| + | * récupérer le répertoire exemples et modifier le Makefile: | ||
| + | < | ||
| + | nemo-henry% diff Makefile-ori Makefile | ||
| + | 4,7c4,7 | ||
| < CC = mpicc | < CC = mpicc | ||
| < F77 = mpif77 | < F77 = mpif77 | ||
| < CXX = mpiCC | < CXX = mpiCC | ||
| + | < HYPRE_DIR = ../hypre | ||
| --- | --- | ||
| > CC = mpcc | > CC = mpcc | ||
| > F77 = mpf77 | > F77 = mpf77 | ||
| > CXX = mpCC | > CXX = mpCC | ||
| + | > HYPRE_DIR = / | ||
| 12c12 | 12c12 | ||
| < COPTS = -g -pedantic -Wall | < COPTS = -g -pedantic -Wall | ||
| Ligne 75: | Ligne 114: | ||
| > -L/ | > -L/ | ||
| > -lmpi | > -lmpi | ||
| - | 37a40 | + | |
| - | > | + | |
| </ | </ | ||
| Ligne 111: | Ligne 149: | ||
| </ | </ | ||
| + | |||
| + | dans le répertoire lapack: | ||
| + | < | ||
| + | > diff lapack/ | ||
| + | < xerbla.c | ||
| + | --- | ||
| + | > xerbla.c\ | ||
| + | > dlamch.c | ||
| + | 112c113 | ||
| + | < all: ${OBJS} dlamch.o | ||
| + | --- | ||
| + | > all: ${OBJS} | ||
| + | 127,129d127 | ||
| + | < dlamch.o : dlamch.c ${LAPACK_HEADERS} | ||
| + | < ${CC} -c dlamch.c | ||
| + | < | ||
| + | </ | ||
| + | |||
| + | ====== problèmes ====== | ||
| + | ===== version 2.2.0b zero-sized struct/ | ||
| + | cette erreur: | ||
| + | < | ||
| + | mpcc -DHAVE_CONFIG_H -I. -I. -I. -I/ | ||
| + | " | ||
| + | cc: acomp failed for sidl_rmi_InstanceRegistry_Impl.c | ||
| + | make[3]: *** [sidl_rmi_InstanceRegistry_Impl.lo] Error 1 | ||
| + | </ | ||
| + | est [[http:// | ||
| + | |||
| + | ===== interface babel ne compile pas ===== | ||
| + | Pour compiler avec l' | ||
| + | Mais la compilation échoue à cause du problème suivant: | ||
| + | < | ||
| + | "/ | ||
| + | </ | ||
| + | This error is due to these lines: | ||
| + | < | ||
| + | #pragma weak sidl_io_Serializer__connectI | ||
| + | struct sidl_io_Serializer__object* | ||
| + | sidl_io_Serializer__rmicast(...); | ||
| + | </ | ||
| + | |||
| + | if we invert the two preceding lines: | ||
| + | < | ||
| + | struct sidl_io_Serializer__object* | ||
| + | sidl_io_Serializer__rmicast(...); | ||
| + | #pragma weak sidl_io_Serializer__connectI | ||
| + | </ | ||
| + | |||
| + | C'est ce qui est expliqué [[http:// | ||
| + | < | ||
| + | Les hacks ont été faits par [[http:// | ||
| + | \\ | ||
| + | Attention, pour utiliser les libs optimisées du constructeur (sun perflib), ne pas oublier les lignes suivantes en argument du configure: | ||
| + | < | ||
| + | > --with-blas-libs=" | ||
| + | > --with-blas-lib-dirs="/ | ||
| + | > --with-lapack-libs=" | ||
| + | > --with-lapack-lib-dirs="/ | ||
| + | </ | ||
| + | |||
| + | |||
| + | ====== Utilisation de l' | ||
| + | Comme cela manque d' | ||
| + | * src/ | ||
| + | |||