Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- scipy [2008/03/05 16:02] – a gerard
+++ scipy [2008/03/27 14:49] – gerard
@@ Ligne 1: / Ligne 1: @@
 ====== numpy ======
-===== Installation =====
+===== Installation avec Python 2.4 =====
   * [[http://www.scipy.org/Download|numpy-1.0.4.tar.gz]]
 se logger devel1 sur nemo:
@@ Ligne 20: / Ligne 21: @@
 </code>
-et enfin:
+remove numpy/distutils/fcompiler/sun.py f77compact from the optionlist, et enfin:
 <code>
 > python setup.py install --prefix=$HOME/lib | & tee INSTALL.LOG
@@ Ligne 52: / Ligne 53: @@
 >>>
 </code>
+===== Installation avec Python 2.5 =====
+se logger devel1 sur nemo:
+<code>
+module load ss12 hpc
+</code>
+fichier site.cfg dans numpy/distutils/
+<code>
+[DEFAULT]
+library_dirs = /opt/studio12/SUNWspro/lib:/opt/csw/lib
+include_dirs = /opt/studio12/SUNWspro/include:/opt/csw/include
+[blas]
+blas_libs = sunperf
+[lapack]
+lapack_libs = sunperf
+</code>
+et enfin:
+<code>
+> setenv LDFLAGS "-L/opt/csw/lib -R/opt/csw/lib"
+> /opt/csw/bin/python setup.py install --prefix=$HOME/lib/blastwave | & tee INSTALL_BLASTWAVE.LOG
+</code>
+et s'installe dans /local/apps/lib/blastwave/lib/python/site-packages
+Le test:
+<code>
+setenv PYTHONPATH /local/apps/lib/blastwave/lib/python/site-packages
+/opt/csw/bin/python -c 'import numpy; numpy.test()'
+</code>
 ====== scipy ======
+===== Installation avec python 2.4 =====
   * scipy-0.6.0.tar.gz
@@ Ligne 98: / Ligne 133: @@
 </code>
+===== Installation avec python 2.5.1 =====
+<code>
+> which python
+/opt/csw/bin/python
+> /opt/csw/bin/python -c 'import os,sys;print os.name,sys.platform'
+posix sunos5
+> /opt/csw/bin/python -c 'import sys;print sys.version'
+.5.1 (r251:54863, Nov  3 2007, 02:54:36) [C]
+</code>
+Puis, en s'inspirant du [[http://mailman.rwth-aachen.de/pipermail/sunhpc/2008-March/000424.html|message]]
+<code>
+> setenv LD_PRELOAD /usr/lib/libmtsk.so
+> wget "http://downloads.sourceforge.net/scipy/scipy-0.5.2.1.tar.gz?modtime=1187640016&big_mirror=0"
+> tar xzf ../downloads/scipy-0.5.2.1.tar.gz
+> cd scipy-0.5.2.1/
+> /opt/csw/bin/python setup.py install --prefix=$HOME/lib/blastwave | & tee INSTALL.LOG
+</code>
 ====== PyML ======
+  * [[http://pyml.sourceforge.net|site]]
+===== Installation avec python 2.4 =====
 <code>
 > cd src/PyML-0.6.15
@@ Ligne 126: / Ligne 188: @@
 </code>
-il faut aller voir dans les distutils de pynum pour comprendre ce qui se passe:
+il faut aller voir dans les distutils de pynum pour comprendre ce qui se passe?!
+===== Installation avec python 2.5 =====
+<code>
+> cd src/PyML-0.6.15
+> /opt/csw/bin/python setup.py build
+</code>
+lorsqu'on a cette erreur:
+<code>
+> python setup.py build                                                         running build
+running build_py
+running build_ext
+building 'PyML/ext/_libsvm' extension
+C compiler: /usr/lib/python2.4/pycc -DNDEBUG
+compile options: '-I/usr/include/python2.4 -c'
+pycc: PyML/ext/libsvm.cpp
+cc: No input file specified, no output generated
+cc: No input file specified, no output generated
+error: Command "/usr/lib/python2.4/pycc -DNDEBUG -I/usr/include/python2.4 -c PyML/ext/libsvm.cpp -o build/temp.solaris-2.10-i86pc-2.4/PyML/ext/libsvm.o" failed with exit status 1
+</code>
+c'est parce qu'il utilise pycc au lieu de pyCC!
+<code>
+> /usr/lib/python2.4/pyCC -DNDEBUG -I/usr/include/python2.4 -c PyML/ext/libsvm_wrap.cpp -o build/temp.solaris-2.10-i86pc-2.4/PyML/ext/libsvm_wrap.o
+</code>
+il faut aller voir dans les distutils de pynum pour comprendre ce qui se passe?!
+====== PyStemmer ======
+s'installe sans problème
+<code>
+/local/apps/src/PyStemmer-1.0.1
+> python setup.py install --prefix=$HOME/lib
+running install
+running build
+running build_ext
+running install_lib
+copying build/lib.solaris-2.10-i86pc-2.4/Stemmer.so -> /local/apps/lib/lib/python2.4/site-packages
+</code>
+====== PyML ======
+  * problèmes de [[compil_pyml|compilation]]