Différences
Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
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| sge [2011/11/18 16:06] – [parallèle] gerard | sge [2015/10/02 11:03] – [les files] gerard | ||
|---|---|---|---|
| Ligne 19: | Ligne 19: | ||
| | big | 8 | 3Go | 1 | machine octopus | | big | 8 | 3Go | 1 | machine octopus | ||
| | long | 8 | 2Go | 8 | 2 machines, charybde et scylla, à réserver au parallèle MPI | | | long | 8 | 2Go | 8 | 2 machines, charybde et scylla, à réserver au parallèle MPI | | ||
| - | | latp | 32 | 8Go | 30 | cette [[http:// | + | | latp | 32 | 256Go | 30 | cette [[http:// |
| Ligne 25: | Ligne 25: | ||
| ==== séquentiel ==== | ==== séquentiel ==== | ||
| + | voir [[http:// | ||
| ==== parallèle ==== | ==== parallèle ==== | ||
| - | Voici un exemple de script, pour lancer un job parallèle (limité à 8 instances) sur la queue long | + | Exemple simple sur holopherne (les homedir ne sont pas en réseau): |
| + | <code shell> | ||
| + | / | ||
| + | et on lance: | ||
| + | < | ||
| + | qsub -q latp -pe impi 4 -cwd -j y ./ | ||
| + | Your job 18540 (" | ||
| + | </ | ||
| + | |||
| + | |||
| + | Voici un autre exemple de script | ||
| < | < | ||
| #!/bin/sh | #!/bin/sh | ||
| Ligne 56: | Ligne 66: | ||
| </ | </ | ||
| + | ==== paramétrique ==== | ||
| + | on veut lancer: | ||
| + | < | ||
| + | monprog 100 | ||
| + | monprog 200 | ||
| + | monprog 400 | ||
| + | ... | ||
| + | </ | ||
| + | Plutôt que d' | ||
| + | < | ||
| + | #!/bin/sh | ||
| + | #$ -N mon_script_parametrique | ||
| + | #$ -cwd | ||
| + | #$ -j y | ||
| + | #$ -S /bin/sh | ||
| + | #$ -M moi@latp.univ-mrs.fr | ||
| + | #$ -m be | ||
| + | #$ -q small | ||
| + | # | ||
| + | num = $(10*(2**($SGE_TASK_ID) - 1)) | ||
| + | / | ||
| + | </ | ||
| + | et on lance par la commande: | ||
| + | < | ||
| + | qsub -q small -t 1-8 mon_script.sh | ||
| + | </ | ||
| + | plus d' | ||