Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- umfpack [2009/11/18 18:39] – gerard
+++ umfpack [2009/12/04 09:45] – gerard
@@ Ligne 1: / Ligne 1: @@
-http://www.cise.ufl.edu/research/sparse/umfpack/"  UMFPACK
+====== UMFPACK ======
+  * [[http://www.cise.ufl.edu/research/sparse/umfpack/]]
-nemo
+====== Installation ======
+^ ^ ^ ^
+| nemo | 4.4 | /usr/local/UMFPACKv4.4 | compilé avec sunperflib |
+| shrek | | /usr/local/UMFPACKv4.4 | compilé avec [[http://www.cs.utexas.edu/users/flame/goto|K. Goto's BLAS]] |
+====== Utilisation ======
+  * /usr/local/UMFPACKv4.4/UMFPACK/Lib/libumfpack.a
+  * /usr/local/UMFPACKv4.4/AMD/Lib/libamd.a
+  * /usr/local/UMFPACKv4.4/UMFPACK/Include
+  * /usr/local/UMFPACKv4.4/AMD/Include
+  * /local/apps/src/UMFPACKv4.4/UMFPACK/Demo/
-shrek
+Utilisation de umfpack dans un code fortran:
+  * umfpack est écrit en C
+  * il existe une interface fortran 77, utilisable en fortran 90
+  * prendre pour exemple le fichier Demo/umf4hb64.f dans /local/apps/src/UMFPACKv4.4/UMFPACK/Demo/ sur nemo
+  * dans son fichier, ajouter les lignes suivantes:
-.4
+<code>
+  call umf4def (control) ! met les parametres par defauts
+  control (1) = 1
+  call umf4pcon (control)
+  call umf4sym (N, N, Ap, Ai, Ax, symbolic, control, info) !       pre-order and symbolic analysis
+  call umf4num (Ap, Ai, Ax, symbolic, numeric, control, info)
+  call umf4fsym (symbolic)
+  call umf4sol (sys, x, RHSV, numeric, control, info)
+  call umf4fnum (numeric)
+  call umf4pinf (control, info)
+</code>
+Pour cela, il faut bien entendu lier votre programme avec le programme umf4_f77wrapper.c, de la facon suivante:
+<code>
+cc -o umf4_f77wrapper.o -DDLONG -m64 -I/usr/local/UMFPACKv4.4/UMFPACK/Include -c umf4_f77wrapper.c
+f90 -o poisson3d_umfpack.o -g -fast -C -e -fpp -stackvar -xcheck=init_local -fpover -ftrap=%none -Xlist -fsimple=0 -fns=no -dalign -O4 -KPIC -xmodel=medium -m64 -c poisson3d_umfpack.f90
+f90 -g -fast -C -e -fpp -stackvar -xcheck=init_local -fpover -ftrap=%none -Xlist -fsimple=0 -fns=no -dalign -O4 -KPIC -xmodel=medium -m64 -o poisson3d_umfpack poisson3d_umfpack.o umf4_f77wrapper.o /usr/local/UMFPACKv4.4/UMFPACK/Lib/libumfpack.a /usr/local/UMFPACKv4.4/AMD/Lib/libamd.a -xlic_lib=sunperf
-/usr/local/UMFPACKv4.4
+</code>
-compil&eacute; avec sunperflib
+====== Config ======
+  * on édite Make.include et Make.solaris (voir lien sur Make.solaris_amd64) avant de compiler
+<code>
+diff /local/apps/src/UMFPACKv4.4/UMFPACK/Make/Make.include-ori /local/apps/src/UMFPACKv4.4/UMFPACK/Make/Make.include
+c50
+< CONFIG = -DNBLAS
+---
+> CONFIG =
+c63
+< # include ../Make/Make.solaris
+---
+> include ../Make/Make.solaris
+</code>
+et
+<code>
+diff /local2/fboyer/UMFPACKv4.4/UMFPACK/Make/Make.solaris /local/apps/src/UMFPACKv4.4/UMFPACK/Make/Make.solaris
+a6
+>
+,13c12,14
+<  CC = cc
+<  CFLAGS = -Xc -xO5 -KPIC -dalign -xtarget=generic64
+<  F77FLAGS =   -xO5 -KPIC -dalign -m64
+---
+> CC = cc
+> CFLAGS = -xO5 -xdepend -DLP64 -xprefetch=auto -xprefetch_level=3 -xipo=2 -m64 -xmodel=medium
+> F77FLAGS =   -xO5 -xdepend -DLP64 -xprefetch=auto -xprefetch_level=3 -xipo=2 -m64 -xmodel=medium
+d22
+< #LIB = -xlic_lib=sunperf -lfai -lfsu -lfui -lsunperf -lm -lsunmath
+c30
+<  LIB =  -xlic_lib=sunperf -lfai -lfsu -lfui -lm
+---
+> LIB = -L/opt/studio12/SUNWspro/lib/amd64 -R/opt/studio12/SUNWspro/lib/amd64 -lsunperf -lm -lpicl -lmtsk
-compil&eacute; avec http://www.cs.utexas.edu/users/flame/goto K. Goto's BLAS
+</code>
+  * 64 bits uniquement
+  * il y a un bug dans les programmes de test, corrige dans umf4hb64.f
+<code>
+diff  /local/apps/src/UMFPACKv4.4/UMFPACK/Demo/umf4hb64.f-ori  /local/apps/src/UMFPACKv4.4/UMFPACK/Demo/umf4hb64.f
+c331
+<      $      n, nz, Ap (n+1), Ai (n), j, i, p
+---
+>      $      n, nz, Ap (n+1), Ai (nz), j, i, p
+</code>
+====== Tests ======
+===== en C =====
+  * prendre le source [[http://iusti.polytech.univ-mrs.fr/~jobic/dokuwiki/doku.php?id=librairies_installees&#umfpack|ici]]
+<code>
+module load ss12
+cc -o umfpack_simple -m64 umfpack_simple.c -I/usr/local/UMFPACKv4.4/UMFPACK/Include -R/usr/local/UMFPACKv4.4/UMFPACK/Lib -L/usr/local/UMFPACKv4.4/UMFPACK/Lib -R/usr/local/UMFPACKv4.4/AMD/Lib -L/usr/local/UMFPACKv4.4/AMD/Lib -lumfpack -lamd -xlic_lib=sunperf
+</code>
+ou
+<code>
+module load ss12u1
+cc -o umfpack_simple -m64 umfpack_simple.c -I/usr/local/UMFPACKv4.4/UMFPACK/Include -R/usr/local/UMFPACKv4.4/UMFPACK/Lib -L/usr/local/UMFPACKv4.4/UMFPACK/Lib -R/usr/local/UMFPACKv4.4/AMD/Lib -L/usr/local/UMFPACKv4.4/AMD/Lib -lumfpack -lamd -xlic_lib=sunperf -lm
+</code>
+===== en fortran =====
-====== Config ======
-  * on édite Make.include et Make.solaris (voir lien sur Make.solaris_amd64) avant de compiler