Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- developpement [2010/05/18 17:16] – gerard
+++ developpement [2017/08/25 07:56] (Version actuelle) – modification externe 127.0.0.1
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 Pour choisir parmi les différentes versions de ces outils, il faut utiliser la commande [[http://modules.sourceforge.net/|module]]
+  * Outils GNU:  gcc (différentes versions suivant les machines), [[gfortran]] (s'installe très bien sur MacOSX voir le site [[http://hpc.sourceforge.net/]])
   * [[compilateurs_sun|Outils Sun]]  (gratuit pour linux et solaris): Sun f90, f95, installé sur octopus, nemo, shrek (pour installer sur un portable linux: [[http://developers.sun.com/sunstudio/downloads/express_readme.html|Lien externe]])
   * Outils Intel (non gratuit): Intel Fortran Compiler (ifc) , installé sur slatp et shrek (pour installer sur un portable linux: [[http://www.latp.univ-mrs.fr/%7Ehenry/fortran_90_intel.html|portable linux]])
-  * Outils GNU:  gcc (différentes versions suivant les machines), gfortran (s'installe très bien sur OSX (Leopard) voir le site [[http://hpc.sourceforge.net/]])
+===== la commande module =====
+Elle est disponible sur les serveurs de calcul, pour le shell **tcsh**
 <note>
 ^ Contexte  ^ Commande ^ Commentaires ^
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 | | ''module load matlab/7.1.0'' | charge une version spécifique |
 </note>
+Pour le shell bash, rajouter la commande suivante dans .bashrc:
+<code>
+. /local/apps/Modules/3.2.6/init/bash
+</code>
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 ==== Fortran ====
 === choisir le compilateur ===
 <code>
-nemo-henry% module avail
+module load sunstudio
-gcc402          hypre2.0.0_hpc6       ss11
+</code> et pour changer vers gfortran:
-gcc             gcc423                ss12
-gcc2g77         gfortran              ss12u1
-gcc345          hpc                   ssexp
-gcc4            hpc82
-</code>
-Cette commande donne la liste des compilateurs
-<code>
-module load ss12u1
-</code> permet de choisir sunstudio 12u1, et pour changer vers gfortran:
 <code>
 module purge
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 Une séquence d'optimisation éprouvée:
 <code>
--xO1 -KPIC -xtarget=opteron -xarch=amd64 -xmodel=medium sur nemo
+-xO1 -KPIC -xtarget=opteron -xarch=amd64 -xmodel=medium
+</code> sur nemo
+<note important>
+Notes sur -KPIC \\
+[[http://docs.sun.com/app/docs/doc/819-0690/chapter4-1?a=view|Position-Independent Code]]
+\\
+si on tombe sur l'erreur:
+<code>
+ld.so.1: exe: fatal: relocation error: R_AMD64_32: file /net/Krill/mmg/minjeaud/PELICANS/PelicansRef/lib/nemo-CC/libpel0.so: symbol (unknown): value 0xfffffd7ffe800000 does not fit
 </code>
-Tips:
+ici, c'est la lib UMFPACK qui n'a pas été compilée avec cette option!
+</note>
+<note tip>Tips:
 Sur nemo, ne pas utiliser --static pour gcc lors de l'edition de liens
+</note>
 On peut retrouver les options utilisées pour compiler un programme avec la commande dump: