Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- matlab [2016/01/27 16:13] – [Les versions disponibles] gerard
+++ matlab [2024/07/18 12:46] (Version actuelle) – [Pour installer Matlab AMU] guillaume
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 ====== Matlab ======
-===== Les versions disponibles =====
+===== Pour installer Matlab AMU =====
-pour faire court, liste des versions installées et disponibles:
+Aller sur le site : [[https://dirnum.univ-amu.fr/fr/logiciel-matlab]] et suivre les instructions
-<Code>
+décompresser le zip,
-module avail matlab
-</Code>
-et pour chaque version, pour voir la date:
-<Code>
-module help matlab/7.1.0
-</Code>
-  * Les 10 jetons de la licence  170472 ne sont utilisables qu'avec la version R14 de 2007 (7.1.0).
-  * Les 2 jetons de la licence 686749 sont utilisables pour toutes les versions depuis la 7.10
-^ jetons ^ MATLAB Version ^ Toolboxes ^ Commandes pour choisir ^ Serveurs concernés ^
-| 10 (pas de maintenance) 170472 | 7.1.0.183 (R14) Service Pack 3 | [[http://www.mathworks.fr/help/releases/R14sp3/helpdesk.html|Compiler, Partial Differential Equation, Signal, Compiler]] | ''module unload matlab;module load matlab/7.1.0'' | charybde, scylla, octopus |
-| 1 (pas de maintenance) | 7.9.0.529 (R2009b) | [[http://www.mathworks.fr/help/releases/R2009b/helpdesk.html|Statistics]] | ''module unload matlab;module load matlab/7.9.0'' | octopus uniquement |
-| 2 (payé par AN, maintenance 2012) 686749 | 7.10.0.499 (R2010a) | [[http://www.mathworks.fr/help/releases/R2010a/helpdesk.html|Global Optimization, Optimization, Statistics, Compiler]] | ''module unload matlab;module load matlab/7.10.0'' | charybde, scylla, octopus, pour les clients, [[#deploiement|voir]]  |
-| id. | 8.1 (R2013a) | [[http://www.mathworks.fr/help/releases/R2015b/helpdesk.html|Global Optimization, Signal, DCT]] | ''module purge matlab;module load matlab/8.1'' | judith, holopherne  |
-| 2 (payé par optimisme, maintenance 2015) 1105012 | 8.6 (R2015b) | id. | ''module purge matlab;module load matlab/8.6'' | judith, holopherne  |
-| id. | 8.6 (R2015b) | + GPU NVidia Quadro K620 2Go | ''/local/apps/MATLAB/R2015b/bin/matlab'' | 29B35 (restrictions) |
-les fichiers d'installation, accessibles sur le réseau du laboratoire:
-  * ''/net/fury/donnees/provisoire/logiciels/matlab/R2010a''
-  * ''/net/fury/donnees/provisoire/logiciels/matlab/R2011b''
-  * ''/net/fury/donnees/provisoire/logiciels/matlab/{download,download.1,download.2}'' image ISO des 3 CDs
-===== Détails sur les commandes =====
-Lancer matlab sur charybde, (octopus n'est pas disponible en permanence, se renseigner avant de l'utiliser!)
 <code>
-[henry@charybde ~]$ module avail matlab
+unzip -X -K matlab_R2024a_glnxa64.zip -d matlab_installer
+cd matlab_installer
--------------------- /local/apps/Modules/3.2.6/modulefiles ---------------------
+sudo ./install
-matlab/7.1.0  matlab/7.10.0 matlab/7.9.0
 </code>
-Cette commande montre les différentes versions disponibles
+===== Bugs d'installation connus =====
+**Impossible de saisir le mot de passe ou le login :** changer de fenêtre et revenir dessus. La fenêtre reprend le focus sur le champ mot de passe ou login.
-Attention, vérifier avec la commande lmstat ("lmstat -a") qu'il reste un jeton de disponible
+===== Erreur de démarrage =====
+==== MESA-LOADER: failed to open iris ====
-en batch:
-<code>
-matlab -nojvm -nodisplay < toto.m > sortie &
-</code>
-sur la version 2012 de matlab (7.14), ajouter:
-<code>
-matlab -nojvm -nodisplay -nodesktop < toto.m > sortie &
-</code>
-===== Lancer Matlab avec SGE =====
+si matlab lancer depuis un terminal, l'erreur ''MESA-LOADER: failed to open iris''
-  * [[calcul|Moyens pour le calcul scientifique au LATP]]
-  * il faut utiliser SGE qui permet de lancer de longs programmes et de recevoir un mail lorsque c'est termnié. Cela évite d'avoir à garder une fenêtre de terminal ouverte en permanence (utile pour lancer les commandes à distance)
-  * voici un exemple:
-  * se connecter sur octopus et créer un répertoire pour vos scripts matlab
 <code>
-mkdir sge-test-matlab
+cd /usr/local/MATLAB/R2024a/sys/os/glnxa64
-cd sge-test-matlab
+sudo mv libstdc++.so.6 libstdc++.so.6.old
+sudo ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/libstdc++.so.6 .
 </code>
-  * dans le dossier //sge-test-matlab//, créer les 2 fichiers suivants, //sge-test-matlab.sh// et  //test-matlab.m//
-<code>
-touch sge-test-matlab.sh test-matlab.m
-chmod u+x sge-test-matlab.sh
-</code>
-  * le contenu du fichier sge-test-matlab.sh
-<code bash>
-#!/bin/bash
-#
-#$ -cwd
-#$ -S /bin/bash
-##$ -o output
-##$ -e output
-#$ -M gerard.henry@univ-amu.fr
-#$ -m be
-#
-. /etc/profile.d/modules.sh
-module purge matlab
-module load matlab/7.13
-cd sge-test-matlab
+==== Failed to load module "canberra-gtk-module ====
-matlab -nodesktop -nodisplay -nojvm < test-matlab.m
+si matlab lancer depuis un terminal, l'erreur ''Failed to load module "canberra-gtk-module"''
-</code>
-  * et le code du script matlab
 <code>
-disp  'matlab test ...'
+sudo apt-get install libcanberra-gtk*
-a=2
+sudo ln -s /usr/lib/x86_64-linux-gnu/gtk-2.0/modules/libcanberra-gtk-module.so /usr/lib/
-b=a+a
-disp ' ... all done.'
 </code>
-  * tester le nouveau script shell, en lançant directement:
-<code>
-./sge-test-matlab.sh
-</code>
-  * puis, lancez-le avec la commande qsub de SGE, depuis le répertoire du script:
-<code>
-qsub -q small ./sge-test-matlab.sh
-</code>
-  * vous devriez recevoir un mail au lancement et à la fin de votre programme
-  * dans votre //homedir//, vous aurez 2 fichiers sge-test-matlab.eNNNN et sge-test-matlab.oNNNN qui contiennent respectivement les erreurs et les sorties de votre programme
-  * cet exemple est adapté de cette [[https://wiki.harvard.edu/confluence/display/USERDOCS/How+to+run+Matlab+using+SGE|page]]
-  * continuer avec SGE sur cette [[calcul|Moyens pour le calcul scientifique au LATP]], et si vous avez besoin de [[http://www.en.it.physik.uni-muenchen.de/dienste/software/matlab/matlab-asc/matlab-asccluster.html|compiler matlab]]
-===== Compiler matlab pour l'exécuter sur holopherne =====
+dans son ''HOMEDIR'' créer un fichier ''java.opts'' contentant la ligne suivante :
-  * parce que holopherne ne dispose pas de matlab
-  * sur octopus, chosir matlab 7.10 ou 7.14
 <code>
-module unload matlab ; module load matlab/7.14
+-Djogl.disable.openglarbcontext=true
 </code>
-  * lancer matlab et initialiser l'environnement de compilation avec la commande "mbuild setup"
-  * compiler votre script matlab (noter le passage des arguments pour empêcher l'affichage du desktop)
-<code>
-mcc -m -R -nojvm -R -nodisplay HLFVlinear.m
-</code>
-  * recopier les 2 fichiers produit par mcc sur holopherne:
-<code>
-scp run_HLFVlinear.sh HLFVlinear holopherne:<dest/>
-</code>
-  * sur holopherne, lancer votre programme en utilisant le script shell crée par mcc, et en donnant le chemin de la librairie matlab
-<code>
-./run_HLFVlinear.sh /opt/MATLAB/MATLAB_Compiler_Runtime/v717
-</code>
-  * pour matlab/7.10.0, la lib est /opt/MATLAB/MATLAB_Compiler_Runtime/v713
-===== disponibilité des versions (lmstat) =====
-  * Sur les serveurs, elle est donné par l'utilisation de la commande **lmstat**. Attention, cette commande est associée à la version de matlab, il faut donc charger la version avant de la lancer
-  * sur les postes clients, cela dépend du type de licence utilisée: serveur ou individuel
-  * en cas de problème, matlab affiche le nom du fichier de licence qu'il veut utiliser et qui contient le nom du serveur de licences. Penser à regarder le site [[https://www2/phplicensewatcher]] pour voir l'état du serveur de licences
-^ version ^ commandes ^ résultat ^ serveur de licence ^
-| 7.1.0 | ''module unload matlab; module load matlab/7.1.0; lmstat -a'' | indique au plus 10 jetons | reglisse |
-| 7.9.0 | ''module unload matlab; module load matlab/7.9.0'' | pas de lmstat, mais 1 seul jeton | N/A |
-| 7.10.0 | ''module unload matlab; module load matlab/7.10.0; lmstat -a'' | indique au 2 plus jetons | nemo |
-====== Les boîtes à outils matlab ======
-^ Version ^ Toolbox ^ Jetons ^ Aide |
-| 7.1.0 | Compiler | 1 | [[http://www.mathworks.com/support/tech-notes/1600/1621.html?BB=1|What should I do before trying to compile?]] |
-| | PDE_Toolbox | 6 | |
-| | Signal_Toolbox | 4 | |
-| 7.9.0 | n.d. | n.d. | |
-| 7.10.0 | Compiler | 5 | [[http://www.mathworks.fr/help/releases/R2010a/toolbox/compiler/]] |
-====== Boite a outils stixbox ======
-===== 18 jan 08 stixbox  sur slatp pour matlab 7 =====
-[[https://turquoise.univ-mrs.fr/Ticket/Display.html?id=2041]]
-===== slatp, shrek =====
-Installé dans la version 6 de matlab (celle par défaut):
-<code>
-slatp:~# cd /usr/local/matlab6/
-slatp:/usr/local/matlab6# mkdir /usr/local/matlab6/local
-slatp:/usr/local/matlab6#  mv /tmp/stixbox/stixbox* /usr/local/matlab6/local/
-slatp:/usr/local/matlab6# mv /tmp/stixbox/install/startup.m toolbox/local/
-</code>
-on ajoute dans le fichier
-<code>
-slatp:/usr/local/matlab6# vi toolbox/local/pathdef.m
-...
-matlabroot,'/local/stixbox:',...
-...
-</code>
-Lancement
-<code>
-slatp:~> matlab -nodisplay
-                              < M A T L A B >
-                  Copyright 1984-2002 The MathWorks, Inc.
-                      Version 6.5.0.180913a Release 13
-                                Jun 18 2002
-  Using Toolbox Path Cache.  Type "help toolbox_path_cache" for more info.
-  To get started, type one of these: helpwin, helpdesk, or demo.
-  For product information, visit www.mathworks.com.
-Environment var $STIX_PATH not set up
-StixBox to be found in:/usr/local/matlab6p5/local/stixbox
->>
-</code>
-==== calypso, mombasa ====
-il s'agit de matlab 7.1
-<code>
-mombasa-henry% matlab -nojvm -nodisplay
-Warning:
-  MATLAB is starting without a display, using internal event queue.
-  You will not be able to display graphics on the screen.
-                              < M A T L A B >
-                  Copyright 1984-2005 The MathWorks, Inc.
-                   Version 7.1.0.183 (R14) Service Pack 3
-                              August 02, 2005
-  To get started, type one of these: helpwin, helpdesk, or demo.
-  For product information, visit www.mathworks.com.
-Environment var $STIX_PATH not set up
-StixBox to be found in:/usr/local/matlab7.1/local/stixbox
->> help stixbox
-  A rudimentary statistics toolbox.
-  Version 1.10, 9-Sep-98
-</code>
-==== Autres machines ====
-elle est installée dans le répertoire /usr/local/stixbox. Pour l'utiliser, il faut taper la commande suivante:
-<code>
->> addpath ('/usr/local/stixbox')
-</code>
-Il doit etre possible de sauvegarder cette modification dans un fichier utilise par matlab (voir support matlab)
-====== Déploiement ======
-Sur un poste client du laboratoire, plusieurs méthodes sont possibles pour installer matlab, suivant la version disponible.
-  * [[install_matlab|Installation]] par montage nfs, les mises à jour sont de la responsabilité de l'ASR.
-  * ou récupérer les cds d'installation, et faire l'installation soi-même (ainsi que les mises à jour éventuelles)
-Pour la licence, un fichier est disponible auprès de l'ASR du laboratoire. Il suffit qu'il contienne une information aussi succincte que:
-<code>
-SERVER nom_serveur ANY 27002
-USE_SERVER
-</code>
-  * ''Le nom « nom_serveur »'' dépend de l'installation. Renseignez vous à [[support@cmi.univ-mrs.fr]]
-====== Problèmes ======