Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- mumps [2007/08/17 16:20] – créée gerard
+++ mumps [2017/08/25 07:56] (Version actuelle) – modification externe 127.0.0.1
@@ Ligne 1: / Ligne 1: @@
+====== MUMPS ======
+  * [[http://graal.ens-lyon.fr/MUMPS/ ]]
+  * sur octopus
+  *
+===== 4.6.4 =====
-http://graal.ens-lyon.fr/MUMPS/  MUMPS
+  * dans ''/local/apps/mumps+mpi/MUMPS_4.6.4''
+  * compilé avec Blacs, Scalapack, metis 4.0.3 et SunMPI (voir  [[http://www.latp.univ-mrs.fr/vfcc/doku.php?id=utilisation_de_mumps]] )
+  * pour le compiler avec MPICH, ne pas oublier -lrt à l'édition de liens
-nemo
+===== 4.10.0 =====
+  * dans ''/local/apps/MUMPS_4.10.0''
+  * blacs et scalapack sont inclus dans sunstudio12.1
+  * la config:
-.6.3
+<code>
+[devel1@octopus ~/MUMPS_4.10.0]$ diff Make.inc/Makefile.SUN.PAR Makefile.inc
+,71c69,71
+< CC      = cc
+< FC = f90
+< FL = f90
+---
+> CC      = mpicc
+> FC = mpif90
+> FL = mpif90
+,77c75,77
+< SCALAP  = -ls3l -lhpcshm
+< INCPAR  = -I/opt/SUNWhpc/include
+< LIBPAR  = -L/opt/SUNWhpc/lib -R/opt/SUNWhpc/lib $(SCALAP)  -lmpi
+---
+> SCALAP  = -lscalapack -lblacs_openmpi
+> INCPAR  = -I/opt/sun/sunstudio12.1/include
+> LIBPAR  = -L/opt/sun/sunstudio12.1/lib/amd64 -R/opt/sun/sunstudio12.1/lib/amd64 $(SCALAP)  -lmpi
+c80
+< LIBBLAS = -lsunperf -lf77compat
+---
+> LIBBLAS = -xlic_lib=sunperf #-lsunperf -lf77compat
+a89,92
+> OPTF    = -m64 -xmodel=medium -KPIC -DALLOW_NON_INIT -DSUN_ -xlic_lib=sunperf
+> OPTL    = -m64 -xmodel=medium -KPIC -xlic_lib=sunperf
+> OPTC    = -m64 -xmodel=medium -KPIC -xlic_lib=sunperf
+</code>
+ * à utiliser avec sunstudio12.1 et SunHPC8.2.1c
+<code>
+module unload sunstudio
+module unload sunhpc
+module unload mpi
+module load sunstudio/12.1
+module load mpi/sunhpc821c
+</code>
-(voir  http://www.latp.univ-mrs.fr/vfcc/doku.php?id=utilisation_de_mumps
+====== Executer l'exemple fourni avec mumps ======
+  * se connecter sur octopus
+  * lancer
-compil&eacute; avec Blacs, Scalapack et SunMPI (voir  http://www.latp.univ-mrs.fr/vfcc/doku.php?id=utilisation_de_mumps">aussi
+<code>
+module load sunhpc
+mpirun -np 2 /local/apps/mumps+mpi/MUMPS_4.6.4/test/dsimpletest < /local/apps/mumps+mpi/MUMPS_4.6.4/test/input_simpletest_real
+</code>
-pour le compiler avec MPICH, ne pas oublier -lrt à l'édition de liens
+====== Problèmes ======
+===== relocation R_X86_64_32 against `a local symbol' can not be used when making a shared object =====
+<code>
+/opt/sun/sunstudio12.1/prod/lib/amd64/ld: /local/apps/mumps+mpi/BLACS/LIB/blacs_MPI-X64LINUX-0.a(igebs2d_.o): relocation R_X86_64_32 against `a local symbol' can not be used when making a shared object; recompile with -fPIC
+/local/apps/mumps+mpi/BLACS/LIB/blacs_MPI-X64LINUX-0.a: could not read symbols: Bad value
+make[1]: *** [/net/Krill/mmg/minjeaud/PELICANS/PelicansRef/lib/octopus-CC/opt2//../libpel2.so] Error 1
+</code>
+<del>avec sunstudio, l'option "-fPIC" s'écrit: ''-xmodel=medium''</del>
+pour mumps, on ajoute ''-xmodel=medium -KPIC'' -> utiliser la librairie /local/apps/mumps+mpi-12oct