**R, RStudio, RWeka, etc...**


====== Problèmes ======
===== 13 juin 16 impossible d'utilsier RStudio à travers X2go sur un mac =====
  * avec un bête "ssh -X server", ça marche
  * depuis X2go, même avec la dernière version de Xquartz (2.7.9), on peut lancer RStudio, mais les menus n'apparaissent pas, et dans la console, les erreurs
<Code>
[ghenry@judith ~]$ rstudio
QXcbConnection: Failed to get the primary output of the screen
QXcbConnection: Failed to get the primary output of the screen
QXcbConnection: XCB error: 172 (Unknown), sequence: 161, resource id: 163, major code: 149 (Unknown), minor code: 20
QXcbConnection: XCB error: 172 (Unknown), sequence: 406, resource id: 163, major code: 149 (Unknown), minor code: 20
</Code>

====== Installations ======


sur MacosX Capitan

  * il faut installer le jre8 et le jdk8
  * il faut aussi [[http://conjugateprior.org/2014/12/r-java8-osx/]]
<Code>
sudo R CMD javareconf
</Code>  
  * puis dans R
<Code>
install.packages('rJava', type='source')
</Code>  
  * voir aussi [[http://paulklemm.com/blog/2015-02-20-run-rjava-with-rstudio-under-osx-10-dot-10/]]
  * à partir de la commande ''/usr/libexec/java_home'', dans RStudio, on va charger
<Code>
dyn.load('/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_31.jdk/Contents/Home/jre/lib/server/libjvm.dylib')
</Code>
ça tombe en marche

  * pour tester
<Code>
source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("RWeka")
library(RWeka)
J48(iris[,5]~.,iris)
</Code>