Afficher la pageAnciennes révisionsLiens de retourHaut de page Cette page est en lecture seule. Vous pouvez afficher le texte source, mais ne pourrez pas le modifier. Contactez votre administrateur si vous pensez qu'il s'agit d'une erreur. ====== Présentation ====== * [[http://www.r-project.org/|Site Web]] * [[http://wiki.r-project.org/rwiki/doku.php?id=tips:using-gui:find_gui|Graphical User Interface]] * [[notes_compil_R|Notes de compilation]] * [[http://cran.r-project.org/doc/manuals/R-admin.html#Installing-packages|Installation de packages]] ====== Utilisation ====== * se logger sur nemo * R24 pour lancer la version 2.4.1 * R24-visu pour lancer la version avec l'interface graphique * R26 pour lancer la version 2.6.1 (compilée avec gcc, utilise Java 1.6) * R pour lancer la version 2.0.1, au cas où il manquerait des packages * utilisation de l'interface graphique pour R24: <code> library(JGR) JGR() </code> En cas de problèmes, voir la rubrique {{problèmes}} ====== Ajout de packages ====== c'est possible sans etre admin, sur nemo, de la façon suivante, pour R26: * s'assurer que le dossier R/i386-pc-solaris2.10-library/2.6 existe dans son compte * télécharger le package à installer * modifier le PATH <code> setenv PATH /opt/csw/gcc3/bin:/opt/csw/bin:${PATH}:/usr/ccs/bin </code> et enfin, installer le package, par exemple: <code> R26 CMD INSTALL /local/apps/downloads/aplpack_1.1.1.tar.gz * Installing to library '/local/henry/R/i386-pc-solaris2.10-library/2.6' * Installing *source* package 'aplpack' ... ** R ** inst ** preparing package for lazy loading Loading required package: tcltk Loading Tcl/Tk interface ... done ** help >>> Building/Updating help pages for package 'aplpack' Formats: text html latex example aplpack.package text html latex example bagplot text html latex example boxplot2D text html latex example faces text html latex example spin3R text html latex example stem.leaf text html latex example ** building package indices ... * DONE (aplpack) </code> en cas de problème, contacter le support [[support@cmi.univ-mrs.fr]] **Remarque sur le dossier library:** \\ utiliser la commande suivante pour connaitre le dossier à créer: <code> > Sys.getenv("R_LIBS_USER") R_LIBS_USER "~/R/i386-pc-solaris2.10-library/2.7" </code> ====== Problèmes ====== * ** 19/04/2007 ** Interface graphique: Exécuter: "bash /usr/local/R-2.4.1/lib/R/library/JGR/cont/run" * ** 19/04/2007 ** à la fin de l'installation de bioconductor: Warning message: installation of package 'ROC' had non-zero exit status in: install.packages(pkgs = pkgs, repos = repos, dependencies = dependencies, logiciel_r.txt Dernière modification : 2017/08/25 09:56de 127.0.0.1