Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- mpi [2009/07/11 09:00] – gerard
+++ mpi [2017/08/25 09:56] (Version actuelle) – modification externe 127.0.0.1
@@ Ligne 1: / Ligne 1: @@
-====== MPICH ======
+====== Utilisation de MPI ======
-sur nemo, slatp, shrek
+connaître l'environnmeent (sur octopus):
-.2.6, 1.2.7p1, 1.2.7.p1
+<code>
-bits et  64 bits
+module avail mpi
-[[http://www-unix.mcs.anl.gov/mpi/mpich/]]
+-------------------- /local/apps/Modules/3.2.6/modulefiles ---------------------
+mpi/openmpi144 mpi/sunhpc8    mpi/sunhpc82   mpi/sunhpc821c
-/usr/local/mpich-1.2.6
+</code>
-/usr/local/mpich-1.2.6-new
+====== Différentes versions ======
+===== OpenMPI =====
+  * [[http://www.open-mpi.org]]
+  * [[openmpi_compilation|compilation]]
+===== HPC Cluster Tools 8 (OpenMPI) =====
+juin 09 ''Sun HPC ClusterTools 8.2 is based on the Open MPI 1.3.3 release.''
+  * [[http://docs.sun.com/app/docs/prod/hpc.cluster82?l=en&a=view|doc]]
+<code>
+module load hpc82
+</code>
+ou
+<code>
+module load sunhpc
+</code>
-/usr/local/mpich-1.2.7p1
-====== HPC Cluster Tools 6 ======
+===== HPC Cluster Tools 6 =====
@@ Ligne 27: / Ligne 43: @@
 </code>
+===== MPICH =====
+sur nemo, slatp, shrek
+.2.6, 1.2.7p1, 1.2.7.p1
+bits et  64 bits
+[[http://www-unix.mcs.anl.gov/mpi/mpich/]]
+/usr/local/mpich-1.2.6
+/usr/local/mpich-1.2.6-new
+/usr/local/mpich-1.2.7p1
-====== HPC Cluster Tools 8 (OpenMPI) ======
-juin 09 ''Sun HPC ClusterTools 8.2 is based on the Open MPI 1.3.3 release.''
-  * [[http://docs.sun.com/app/docs/prod/hpc.cluster82?l=en&a=view|doc]]
-<code>
-module load hpc82
-</code>
@@ Ligne 71: / Ligne 93: @@
 ====== Tests PETSC ======
+===== petsc-3.1-p8 =====
+sur octopus, faire:
+<code>
+module load sunhpc petsc3.1_p8_hpc8
+</code>
+  * récupérer l'{{:petsc:petsc3.1_example.tar|exemple}} (fourni par Yann Jobic de l'IUSTI)
+  * puis lancer la compilation et l'exécution:
+<code>
+make -f Makefile_petsc3.1 solv_ksp
+mpirun -np 2 ./solv_ksp -mat_type mpiaij -pc_type lu -pc_factor_mat_solver_package mumps -nx 1000 -ny 1000 -debug 0
+</code>
+===== petsc-2.3.0 =====
 <code>