Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

--- scipy [2008/03/27 18:11] – gerard
+++ scipy [Date inconnue] (Version actuelle) – supprimée - modification externe (Date inconnue) 127.0.0.1
@@ Ligne 1: / Ligne 1: @@
-====== A propos de python ======
-On trouve plusieurs versions de python sur nemo:
-^ origine ^ chemin ^ version ^ PYTHONPATH ^ 32/64 ^
-| SUNWPython | /usr/bin/python | 2.4.4 | /local/apps/sunw/lib/python2.5/site-packages | |
-| SMCpython | /usr/local/bin/python | 2.5.1 | /local/apps/smc/lib/python2.5/site-packages | |
-| CSWpython | /opt/csw/bin/python | 2.5.1 | /local/apps/csw/lib/python2.5/site-packages | |
-| sources | /local/apps/bin/python | 2.5.2 | /local/apps/lib/python2.5/site-packages | |
-===== Compilation de python =====
-<code>
-./configure --prefix=/local/apps \
-CC=cc CXX=CC \
-CPPFLAGS="-I/usr/sfw/include" \
-LDFLAGS="-L/usr/sfw/lib -R/usr/sfw/lib"
-</code>
-Penser à commenter OPT: dans le Makefile
-====== numpy ======
-===== Installation avec Python 2.4 =====
-  * [[http://www.scipy.org/Download|numpy-1.0.4.tar.gz]]
-se logger devel1 sur nemo:
-<code>
-module load ss12 hpc
-</code>
-fichier site.cfg dans numpy/distutils/
-<code>
-[DEFAULT]
-library_dirs = /opt/studio12/SUNWspro/lib
-include_dirs = /opt/studio12/SUNWspro/include
-[blas]
-blas_libs = sunperf
-[lapack]
-lapack_libs = sunperf
-</code>
-remove numpy/distutils/fcompiler/sun.py f77compact from the optionlist, et enfin:
-<code>
-> python setup.py install --prefix=$HOME/lib | & tee INSTALL.LOG
-</code>
-et s'installe dans /local/apps/lib/lib/python2.4/site-packages/
-Le test:
-<code>
-setenv PYTHONPATH /local/apps/lib/lib/python2.4/site-packages/
-python -c 'import numpy; numpy.test()'
-</code>
-échoue sur:
-<code>
-======================================================================
-FAIL: check_large_types (numpy.core.tests.test_scalarmath.TestPower)
-----------------------------------------------------------------------
-Traceback (most recent call last):
-  File "/local/apps/lib/lib/python2.4/site-packages/numpy/core/tests/test_scalarmath.py", line 52, in check_large_types
-    assert b == 6765201, "error with %r: got %r" % (t,b)
-AssertionError: error with <type 'numpy.float96'>: got 6765201.00000000000364
-</code>
-et pourtant:
-<code>
-nemo-henry% /usr/bin/python
-Python 2.4.4 (#1, Jan  9 2007, 23:31:33) [C] on sunos5
-Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
->>> 6765201 == 6765201.00000000000364
-True
->>>
-</code>
-===== Installation avec Python 2.5 =====
-se logger devel1 sur nemo:
-<code>
-module load ss12 hpc
-</code>
-fichier site.cfg dans numpy/distutils/
-<code>
-[DEFAULT]
-library_dirs = /opt/studio12/SUNWspro/lib:/opt/csw/lib
-include_dirs = /opt/studio12/SUNWspro/include:/opt/csw/include
-[blas]
-blas_libs = sunperf
-[lapack]
-lapack_libs = sunperf
-</code>
-et enfin:
-<code>
-> setenv LDFLAGS "-L/opt/csw/lib -R/opt/csw/lib"
-> /opt/csw/bin/python setup.py install --prefix=$HOME/lib/blastwave | & tee INSTALL_BLASTWAVE.LOG
-</code>
-et s'installe dans /local/apps/lib/blastwave/lib/python/site-packages
-Le test:
-<code>
-setenv PYTHONPATH /local/apps/lib/blastwave/lib/python/site-packages
-/opt/csw/bin/python -c 'import numpy; numpy.test()'
-</code>
-===== Installation avec python 2.5.2 =====
-python a été recompilé à partir des sources:
-<code>
-> module load ss12 hpc
-> setenv PATH /local/apps/lib/bin:/opt/SUNWhpc/bin:/opt/studio12/SUNWspro/bin:/usr/local/wrapper/bin:/usr/bin:/usr/bin:/usr/ccs/bin:/usr/sfw/bin
-> python setup.py install --prefix=$HOME/lib | & tee INSTALL.LOG
-====== scipy ======
-===== Installation avec python 2.4 =====
-  * scipy-0.6.0.tar.gz
-<code>
-> which python
-/usr/bin/python
-> python -c 'import os,sys;print os.name,sys.platform'
-posix sunos5
-> python -c 'import sys;print sys.version'
-.4.4 (#1, Jan  9 2007, 23:31:33) [C]
->
-> python setup.py config_fc --help-fcompiler
-SunFCompiler instance properties:
-  archiver        = None
-  compile_switch  = '-c'
-  compiler_f77    = ['/opt/studio12/SUNWspro/bin/f90', '-ftrap=%none', '-
-                    f77', '-xcode=pic32']
-  compiler_f90    = ['/opt/studio12/SUNWspro/bin/f90', '-xcode=pic32']
-  compiler_fix    = ['/opt/studio12/SUNWspro/bin/f90', '-fixed', '-
-                    xcode=pic32']
-  libraries       = ['fsu', 'sunmath', 'mvec']
-  library_dirs    = []
-  linker_exe      = None
-  linker_so       = ['/opt/studio12/SUNWspro/bin/f90', '-Bdynamic', '-G', '-
-                    Bdynamic', '-G']
-  object_switch   = '-o '
-  ranlib          = None
-  version         = LooseVersion ('8.3')
-  version_cmd     = ['/opt/studio12/SUNWspro/bin/f90', '-V']
-Fortran compilers found:
-  --fcompiler=sun  Sun or Forte Fortran 95 Compiler (8.3)
-</code>
-Puis, en s'inspirant du [[http://mailman.rwth-aachen.de/pipermail/sunhpc/2008-March/000424.html|message]]
-<code>
-> setenv LD_PRELOAD /usr/lib/libmtsk.so
-> wget "http://downloads.sourceforge.net/scipy/scipy-0.5.2.1.tar.gz?modtime=1187640016&big_mirror=0"
-> tar xzf ../downloads/scipy-0.5.2.1.tar.gz
-> cd scipy-0.5.2.1/
-> python setup.py install --prefix=$HOME/lib | & tee INSTALL.LOG
-</code>
-===== Installation avec python 2.5.1 =====
-<code>
-> which python
-/opt/csw/bin/python
-> /opt/csw/bin/python -c 'import os,sys;print os.name,sys.platform'
-posix sunos5
-> /opt/csw/bin/python -c 'import sys;print sys.version'
-.5.1 (r251:54863, Nov  3 2007, 02:54:36) [C]
-</code>
-Puis, en s'inspirant du [[http://mailman.rwth-aachen.de/pipermail/sunhpc/2008-March/000424.html|message]]
-<code>
-> setenv LD_PRELOAD /usr/lib/libmtsk.so
-> wget "http://downloads.sourceforge.net/scipy/scipy-0.5.2.1.tar.gz?modtime=1187640016&big_mirror=0"
-> tar xzf ../downloads/scipy-0.5.2.1.tar.gz
-> cd scipy-0.5.2.1/
-> /opt/csw/bin/python setup.py install --prefix=$HOME/lib/blastwave | & tee INSTALL.LOG
-</code>
-====== PyStemmer ======
-s'installe sans problème
-<code>
-/local/apps/src/PyStemmer-1.0.1
-> python setup.py install --prefix=$HOME/lib
-running install
-running build
-running build_ext
-running install_lib
-copying build/lib.solaris-2.10-i86pc-2.4/Stemmer.so -> /local/apps/lib/lib/python2.4/site-packages
-</code>
-====== PyML ======
-  * problèmes de [[compil_pyml|compilation]]