R, RStudio, RWeka, etc…
Problèmes
13 juin 16 impossible d'utilsier RStudio à travers X2go sur un mac
- avec un bête “ssh -X server”, ça marche
- depuis X2go, même avec la dernière version de Xquartz (2.7.9), on peut lancer RStudio, mais les menus n'apparaissent pas, et dans la console, les erreurs
[ghenry@judith ~]$ rstudio QXcbConnection: Failed to get the primary output of the screen QXcbConnection: Failed to get the primary output of the screen QXcbConnection: XCB error: 172 (Unknown), sequence: 161, resource id: 163, major code: 149 (Unknown), minor code: 20 QXcbConnection: XCB error: 172 (Unknown), sequence: 406, resource id: 163, major code: 149 (Unknown), minor code: 20
Installations
sur MacosX Capitan
- il faut installer le jre8 et le jdk8
- il faut aussi http://conjugateprior.org/2014/12/r-java8-osx/
sudo R CMD javareconf
- puis dans R
install.packages('rJava', type='source')
- à partir de la commande
/usr/libexec/java_home
, dans RStudio, on va charger
dyn.load('/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_31.jdk/Contents/Home/jre/lib/server/libjvm.dylib')
ça tombe en marche
- pour tester
source("http://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite("RWeka") library(RWeka) J48(iris[,5]~.,iris)